Юридическая клиника Института юстиции БГУ осуществляет сотрудничество и взаимодействие со следующими органами и учреждениями:

- с Управлением Министерства юстиции РФ по Иркутской области – совместная работа по правовому информированию населения и пропаганде правовых знаний; предоставление отчетной информации.

- с Уполномоченным по правам человека в Иркутской области – участие в совместных мероприятиях (конференции, круглые столы).

- с Иркутской областной государственной научной библиотекой им.И.И.Молчанова-Сибирского – общественная приемная Юридической клиники ЮИ БГУ  - прием граждан в Публичном центре правовой информации.

- с Региональным Центром содействия трудоустройству и адаптации выпускников к рынку труда – участие студентов-консультантов в ярмарках вакансий.

- с Общественной палатой Иркутской области.

- с Государственным юридическим бюро.

- с комитетом по законодательству о государственном строительстве и местном самоуправлении Законодательного собрания Иркутской области – участие в работе по мониторингу реализации закона Иркутской области по оказанию бесплатной юридической помощи.